1. 납부의 고지
건설교통부장관은 이 법에 의하여 개발부담금을 부과결정한 때에는 납부의무자에게 납부고지서를 발부하여야 한다(법 제15조1항).
납부고지서를 발부할 때에는 납부의무자에게 납부금액 및 그 산출근거·납부기한과 납부장소를 명시하여야 한다(령 제16조).
개발부담금은 이를 부과고지할 수 있는 날부터 5년이 경과한 후에는 부과할 수 없다.
이 경우 개발부담금을 부과고지할 수 있는 날은 대통령령으로 정한다(법 동조2항).
2. 납부의 원칙
개발부담금의 납부의무자는 부과일부터 6월이내에 개발부담금을 납부하여야 한다(법 제16조 1항).
개발부담금은 현금에 의한 납부를 원칙으로 하되, 당해 부과대상토지 및 그와 유사한 토지에 의한 납부(이하 "물납"이라 한다)를 인정할 수 있다(법 동조2항).
3. 납부기일전 징수
1) 징수대상
건설교통부장관은 납부의무자가 다음 하나에 해당하는 사유가 있을 때에는 납부기일전이라도 이미 부과된 개발부담금을 징수할 수 있다(법 제16조의2 제1항).
① 국세·지방세 기타 공과금에 대하여 체납처분을 받은 때
② 강제집행을 받은 때
③ 파산의 선고를 받은 때
④ 경매가 개시된 때
⑤ 법인이 해산한 때
⑥ 개발부담금을 포탈하고자 하는 행위가 있다고 인정되는 때
⑦ 개발부담금에 대한 납부관리인을 두지 아니하고 국내에 주소 또는 거소를 두지 아니하게 된때
2) 납부기일과 통지
건설교통부장관은 납부기일전에 징수하고자 하는 때에는 그 납부기일을 부담금고지일부터 5일이상이 경과된 날로 하여야 하고, 그 고지서에는 납부기일전에 징수한다는 뜻과 납부기일의 변경의 뜻을 기재하여 고지하여야 한다(법 제16조의2 제2항, 령 제18조의2).
4. 납부의 연기 및 분할납부
1) 연기 및 분할의 대상
건설교통부장관은 개발부담금의 납부의무자가 다음 하나에 해당하는 사유로 개발부담금을 납부하기가 곤란하다고 인정되는 때에는 당해 개발사업목적에 따른 이용상황등을 고려하여 3년의 범위내에서 납부기일을 연기하거나 5년의 범위내에서 분할납부를 인정할 수 있다. (법 제17조1항).
① 재해 또는 도난으로 재산에 심한 손실을 받은 때
② 사업에 현저한 손실을 받은 때
③ 사업이 중대한 위기에 처한 때
④ 납부의무자 또는 그 동거가족의 질병이나 중상해로 장기치료를 요하는 때
⑤ 기타 공장용지조성사업(산업단지개발사업을 포함한다)의 경우로서 부담금부과액이 3,000만원을 초과하고, 납부의무자가 담보를 제공(국세기본법 제31조의 규정)하는 경우 (령 제19조2항)
2) 납부연기 및 분할납부의 신청
납부의무자가 개발부담금의 납부기일의 연기 및 분할납부를 인정받고자 하는 때에는 건설교통부장관에게 신청하여야 한다(법 제17조2항).
신청은 부담금의 금액, 토지의 소재지, 대상면적· 위치·가격 등을 기재한 신청서를 부담금납부고지일부터 120일이내에 건설교통부장관에게 제 출하여야 하며(령 제18조1항의 규정), 건설교통부장관은 신청을 받은 날부터 30일이내에 신청인에게 연기 및 분할납부 여부를 서면으로 통지(동조2항의 규정)하여야 한다(령 제19조1항).
3) 이자가산
건설교통부장관은 납부를 연기한 기간 또는 분할납부로 납부가 유예된 기간에 대하여는 개발부담금에 정기예금이자율에 상당하는 연 10/100을 가산하여 징수하여야 한다.
(법 제17조3항, 령제19조3항).
5. 납부의 독촉과 체납처분
1) 납부의 독촉
건설교통부장관은 개발부담금의 납부의무자가 지정된 기간내에 그 개발부담금을 완납하지 아니한 때에는 납부기한 경과후 10일이내에 독촉장을 발부하여야 한다(법 제18조1항).
개발부담금 또는 체납된 개발부담금의 납부의무자가 납부기한까지 완납하지 아니한 경우에는 국세징수법 상가산금과 중가산금을 준용한다(법 제18조2항).
2) 체납처분
개발부담금의 납부의무자가 독촉장을 받고 지정된 기한까지 개발부담금 및 가산금등을 완납하지 아니한 때에는 건설교통부장관은 국세체납처분의 예에 의하여 이를 징수할 수 있다(법 제19조 1항). 분할납부가 인정된 개발부담금을 징수함에 있어서는 분할납부의 규정(법 제17조제1항
의 규정)에 불구하고 1회의 분할납부가 체납된 때에는 동 납부기간 이후 분할납부하여야 할 개발부담금 및 가산금등의 전액을 체납처분시에 일괄 징수한다(동조2항).
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국세를 납부기한까지 완납하지 아니한 때에는 그 납부기한이 경과한 날로부터 체납된 국세에대하여 5/100에 상당하는 가산금을 징수한다. 
